Silene dioica as a model species for heavy metal tolerance
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 14 (SGA0201300006)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
13-34962P
Alternative language
Project name in Czech
Silenka dvoudomá jako modelová rostlina pro studium tolerance k těžkým kovům
Annotation in Czech
Vysoké koncentrace těžkých kovů v prostředí jsou závažnou překážkou pro život většiny živých organizmů. Rostliny, které dokážou přežívat v kontaminovaných oblastech jsou na tuto skutečnost adaptovány. Způsob, jakým dokážou růst v těchto lokalitách je často kódován v jejich genomech. Jednou z prvních rostlin, u které byla tato schopnost adaptace pozorována je Silenka dvoudomá. Silenka dvoudomá je schopna přežívat na lokalitách s vysokým obsahem mědi a kadmia. Analýzou a srovnáním transkriptomů rostlin Silenky dvoudomé z kontaminované a nekontaminované oblasti chceme zjistit, které geny jsou zodpovědné za toleranci k těžkým kovům, zejména mědi, a jak se liší jejich exprese v kořenech a nadzemní části. Kombinací dat z nových sekvenačních technologií a tradičních genomických přístupů budou odhaleny nové geny a genetické dráhy zodpovědné za fyziologii těžkých kovů u Silenky dvoudomé.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
ED - Physiology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Research activities planned in the project were accomplished. Up to now de novo transcriptome assembly of copper tolerant ecotype Silene dioica, for male and female individuals have been deposited in NCBI sequence read archive. Key results of the project were not published yet.
Solution timeline
Realization period - beginning
Feb 1, 2013
Realization period - end
Dec 7, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
3,880 thou. CZK
Public financial support
3,880 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK