Structure and function of light harvesting complexes of selected heterokont algae: integration of biochemical, biophysical and genomic data
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-01377P
Alternative language
Project name in Czech
Struktura a funkce světlosběrných komplexů vybraných heterokontních řas: integrace biochemických, biofyzikálních a genomických dat
Annotation in Czech
Světlosběrné komplexy mají zásadní vliv na život fotosyntetických organismů. Pět set milionů let evoluce vedlo u heterokontních řas k pozoruhodnému rozrůznění anténních komplexů z rodiny LHC projevujícímu se mimo jiné přítomností či absencí chlorofylu c a různých druhů karotenoidů ve světlosběrných i fotoprotekčních rolích. Dostupnost genomických dat nyní umožňuje popsat světlosběrné antény na úrovni jednotlivých genových produktů. V předkládaném projektu budeme charakterizovat antény tří modelových organismů, dvou druhů rodu Nannochloropsis a Aureococcus anophagefferens, v závislosti na různých růstových podmínkách. Cílem je biochemicky a biofyzikálně zmapovat strukturně-funkční variabilitu světlosběrných komplexů a nalézt její vztah k variabilitě genetické. To umožní ověření teze, že heterokontní antény jsou rozmanitější než je nyní obecně přijímáno. Součástí této práce bude posouzení role karotenoidů při zachycování světla, zhášení tripletních stavů a v nefotochemickém zhášení.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The goal of this project was the investigation of yet unstudied algae with photosynthetically unique plastid complexes. Substantial outcomes are the description of light harvesting complex of Nannochloropsis oceanica, nonphotochemic quenching in this and other eustygmatophytes, PSI structure and VCP excitation transfer pathways. Results were published in 4 articles in higher impacted journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 4, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2017
Finance
Total approved costs
5,301 thou. CZK
Public financial support
5,301 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK