Design of novel peptidic inhibitors of cysteine and aspartic proteases
Project goals
The project is focused on design of novel inhibitors of selected proteases associated with important physiological and pathophysiological processes. Inhibitory regulation of two model biochemical systems will be studied: (1) cysteine aminopeptidases inhuman pathology, (2) digestive aspartic proteases of insect pests. Namely: Dipeptidyl peptidase I activates cytotoxic proteases in immune cells (CT lymphocytes and NK cells). High levels of aminopeptidase cathepsin H are associated with metastasis ofseveral types of tumors. Aspartic protease cathepsin D plays central function in midgut of Colorado potato beetle. Its inhibitors coded in transgenic crops are resistance factors against pests. Low molecular weight inhibitors of the target enzymes willbe designed de novo using technology of combinatorial peptide libraries. Further, rational design will be performed based on propart "activation" peptides and molecular graphics. The inhibitors will be synthesized and tested on their activity,
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj nových peptidových inhibitorů cysteinových a aspartátových proteas
Annotation in Czech
Projekt se zabývá vývojem nových inhibitorů vybraných proteas, které jsou spojeny s významnými fyziologickými a patofyziologickými procesy. Studována bude inhibiční regulace dvou modelových biochemických systémů: (1) cysteinové aminopeptidasy vpathologiičlověka a (2) trávicí aspartátové proteasy hmyzích škůdců. Konkrétně jde o tři enzymy: Dipeptidyl peptidasa I aktivuje cytotoxické proteasy v buňkách imunitního systému (CT lymfocytech a NK buňkách). Vysoké hladiny aminopeptidasy kathepsinu Hjsou spojeny s metastází některých typů nádorů. Aspartátová proteasa typu kathepsinu D má klíčovou funkci v trávicím traktu mandelinky bramborové - inhibitory tohoto enzymu kódované v transgenních plodinách představují faktory rezistence proti škůdcům.Nízkomolekulární inhibitory uvedených enzymů budou navrženy de novo s využitím technologie kombinatorních peptidových knihoven. Dále bude proveden racionální design podle struktury propartových "aktivačních" peptidů s využitím molekulární grafiky.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
CEP - another secondary branch
—
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Inhibitory regulation of two proteolytic physiological systems was characterized: cysteine aminopeptidases in human pathology, and digestive aspartic proteases of insect pests. (1) The unique mechanism of activity regulation connected with the oligomeriz
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2001
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GP/U/N/A:8
Data delivery date
Jul 23, 2008
Finance
Total approved costs
846 thou. CZK
Public financial support
605 thou. CZK
Other public sources
295 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
846 CZK thou.
Public support
605 CZK thou.
71%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
CE - Biochemistry
Solution period
01. 01. 2001 - 01. 01. 2004