Study the conformational changes of polycationic sequential polypeptide complexes with porphyrins using vibrational circular dichroism spectroscopy
Project goals
Interactions of porphyrins with proteins, during which the porphyrin-protein complexes are formed, have been important in many biological processes: in primary stages of photosynthesis, transfer of energy or in the photodynamic therapy. Importance of thepolypeptidic matrix allowing the function of porphyrins is generally accepted and mechanism of polypeptide and protein interactions with porphyrins has been intensively investigated by using a variation of spectroscopic methods. However, the porphyrin part of complexes has been mainly studied. In this project, the attention is focused into a new way. The main goal is to study the conformational changes of peptide part of polypeptide/porphyrin complexes that are induced by non-covalent interaction withporphyrins. A modern and highly conformation sensitive technique, vibrational circular dichroism spectroscopy (VCD), will be used in combination with electronic circular dichroism spectroscopy (ECD) in this project. Non-covalent interactions of selected
Keywords
vibrational circular dichroismstructureconformationinteractionpeptides
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 6 (SGA02006GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
203/06/P371
Alternative language
Project name in Czech
Studium strukturních změn komplexů polykationických sekvenčních polypeptidů s porfyriny pomocí spektroskopie vibračního cirkulárního dichroismu
Annotation in Czech
Interakce porfyrinů a bílkovin, při kterých vznikají porfyrin-bílkovinné komplexy, mají význam v mnoha biologicky významných procesech: například v primárních stádiích fotosyntézy, přenosu energie nebo ve fotodynamické terapii. Důležitost polypeptidové matrice pro funkce porfyrinů je všeobecně přijímána a mechanismus interakce polypeptidů a bílkovin s porfyriny je intenzivně studován různými spektrálními metodami. Důraz byl však doposud kladen především na sledování porfyrinové části komplexu. Ve studiích, které jsou součástí předkládaného projektu, je pozornost upřena novým směrem, a to na sledování konformačních změn peptidové části komplexu, ke kterým dochází při nekovalentních interakcích s porfyriny. Pro tyto studie bude využita moderní, konformačně vysoce citlivá technika spektroskopie vibračního cirkulárního dichroismu (VCD) v kombinaci se spektroskopií elektronového cirkulárního dichroismu (ECD). Nekovalentní interakce vybraných polykationických sekvenčních polypeptidů s porfyriny
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Spectroscopic analysis of the sequential cationic oligopeptides (Lys-Ala-Ala)n using VCD, ECD, IR and UV/VIS absorption resulted in a consistent and reasonably complete picture of their conformational behavior in solution at the different physico-chemica
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GP-U/03:3
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
672 thou. CZK
Public financial support
672 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
672 CZK thou.
Public support
672 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
CB - Analytical chemistry, separation
Solution period
01. 01. 2006 - 31. 12. 2008