Dynamic structure and function of the cell nucleus associated with DNA breaks
Project goals
Double-strand DNA breaks (dsb) induced by ionizing radiation represent a serious damage of the genome, which can lead to neoplastic transformation if not repaired properly. Disclosure of dsb-reparation mechanisms is therefore very important for our better understanding to oncogenic transformation and for streamlining of tumor radiotherapy. Recently we have observed a centripetal movement of centromeres in the nucleus after gamma irradiation, which may relate with dsb-reparation. It follows from ourprevious results that chromatin structure and its nuclear topology plays an important role in regulation of gene expression, cell differentiation and emergency of tumor diseases. For all that, the "topological side"of nuclear processes regulation is still notwell understood and is often disregarded. The potential changes induced by irradiation in nuclear architecture and nuclear topology of chromatin will be studied on large populations of spatially fixed cells of different types and also on
Keywords
dynamic structure of the cell nucleusDNA reparationchromatine structurehigh-resolution cytometry
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 6 (SGA02006GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/06/P349
Alternative language
Project name in Czech
Dynamická struktura a funkce buněčného jádra související s reparací DNA zlomů
Annotation in Czech
Dvouřetězcové zlomy DNA (dsb) indukované ionizujícím zářením představují závažná poškození genomu, která mohou vést až k iniciaci neoplastické transformace, nejsou-li správně opravena. Odhalení mechanismů reparace dsb má proto velký význam pro naše porozumění onkogenní transformaci a zefektivnění radioterapie nádorových chorob. Po ozáření buněk paprsky gama jsme dříve pozorovali v jádře dostředivý pohyb centromer, který může souviset s reparací dvouřetězcových zlomů. Z našich dalších výsledků také vyplývá, že struktura chromatinu a jeho jaderná topologie hrají důležitou úlohu v regulaci genové exprese, buněčné diferenciace a vzniku nádorových onemocnění. Přesto je tato "topologická stránka" regulace jaderných procesů jen velmi málo objasněna a často opomíjena. Zářením indukované potenciální změny jaderné topologie chromatinu a jaderné architektury v čase budou studovány na velkých populacích prostorově (3D) fixovaných buněk různých buněčných typů a s pomocí GFP konstruktů také na jednotlivých
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
In the frame of the project, new important results concerning induction of DNA double strand breaks (DSB), the mechanism of thein repair and formation of chromosomal translocations were obtained. By the means of Immuno-FISH method, ?H2AX foci were direct
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GP-U/03:3
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
1,086 thou. CZK
Public financial support
1,086 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
1 086 CZK thou.
Public support
1 086 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2006 - 31. 12. 2008