Localization of mitochondrion in the cell of oxymonads
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 8 (SGA02008GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/08/P280
Alternative language
Project name in Czech
Hledání mitochondrie v buňce oxymonád
Annotation in Czech
Oxymonády patří k nejméně prozkoumaným eukaryotům, ačkoliv má jejich buňka několik zvláštních rysů, zejména absenci mitochondrie. Klasická aerobní mitochondrie chybí u celé řady eukaryotických skupin, intenzivní studium těchto organismů však odhalilo, ževšechny ukrývají anaerobní mitochondrii různých forem - hydrogenozómy a mitozómy. Proto v současnosti převládá názor, že mitochondrie provází eukaryota od útlého "mládí" a že je pro eukaryota nepostradatelná i poté, co pozbyla většinu svých funkcí včetněenergetického metabolismu. Cílem projektu je odstranit otazník, který visí nad oxymonádami v tomto ohledu, systematickým studiem vnitrobuněčné lokalizace proteinů, u kterých lze předpokládat funkci v pozůstatku mitochondrie. Do projektu vstupuji vybavenosmi kmeny oxymonád, cDNA knihovnou, 3000 osekvenovanými EST a odhadem části proteomu mitochondrie rodu Trimastix příbuzného oxymonádám. Neexistenci mitochondrie nelze de facto dokázat, avšak i výrazné zpochybnění její existence by v tomto ohledu učinilo
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
EA - Morphology and cytology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
On the basis of phylogenomic analysis we have shown that oxymonads belong into the group Metamonada, kingdom Excavata. Only four transcripts of putative mitochondrial proteins have been detected among 428 thousand reads of transcriptome of Monocercomonoides (strain Pa203): pyruvate:ferredoxin oxidoreductase, [FeFe]hydrogenase and both subunits of pyridine nucleotide transhydrogenase (PNT); PNT be
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 12, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-GA0-GP-U/04:3
Data delivery date
Mar 20, 2015
Finance
Total approved costs
1,096 thou. CZK
Public financial support
1,096 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK