Early diagnostics of leukemia using DNA-microchip technology and by monitoring of epigenetic changes
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Standardní projekty 7 (SGA02004GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Včasná diagnostika leukémií užitím technologie DNA-mikročipů a sledováním epigenetických změn
Annotation in Czech
Pomocí technologie DNA-mikročipů budou stanoveny expresní mapy v buňkách kostní dřeně či imobilizované krve pacientů s různými typy leukémií, v různých stadiích vývoje a porovnány s daty získanými z buněk nepostižených kancerogenezí. Rozdíly zjištěné porovnáním expresních map ve zdravých a nádorových buňkách v různém stupni progrese a diferenciace nám umožní identifikovat primární, již známé, ale i nové geny, jejichž chybná funkce přispívá k rozvinutí choroby. Dále by mělo být zjištěno, jak se změna aktivity těchto genů odráží v aktivitě dalších známých a i neznámých genů a jaká je lokalizace těchto genů na odpovídajících chromosomech. Pro korelování míry exprese a epigenetických změn bude použita FISH a cytometrie s vysokým rozlišením. Strukturálním-epigenetickým- studiím budou podrobeny chromosomy s pozměněnou mírou exprese. Změny ve struktuře chromatinu buněk pacientů s leukémií v různých stadiích onemocnění oproti kancerogenezí nepostiženým buňkám budou porovnány se změnami exprese.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
FD - Oncology and haematology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
JD - Use of computers, robotics and its application
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Expression activity of thousands of genes was obtained by microarrays analysis. The genes came from cell lines, bone marrow cells and peripheral blood cells harvested from patients with leukemia. Many interesting results were discovered by the project. D
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GP-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
723 thou. CZK
Public financial support
723 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK