Laser desorption/ionization mass spectrometry analysis of small molecules in biological samples
Project goals
The project deals with the development of matrix-assisted and matrix-free laser desorption/ionization mass spectrometry (MA)LDI-MS for the analysis of small molecules in biological samples. Samples of rat urine, plasma and tissues will be obtained afterselected drug administration together with placebo samples with subsequent drug metabolite analysis. Further, samples of human tissues (health x tumor) will be analyzed with the aim to obtain information about present biomarkers of tumor disease and possible future application in the early clinical diagnostics. Particular samples will be characterized using MALDI imaging to obtain 2D images with the information about present small molecules, their amount and distribution in studied tissues. Parallel measurements using ultra high performance liquid chromatography/atmospheric pressure ionization tandem mass spectrometry (UHPLC/API-MS/MS) will be performed for the profiling of individual group of compounds with the emphasis on the elemental composition determination based on the high mass accuracy and characteristic fragmentation.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 12 (SGA02012GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P206-12-P065
Alternative language
Project name in Czech
Analýza malých molekul s využitím hmotnostní spektrometrie s desorpcí/ionizací laserem v biologických vzorcích
Annotation in Czech
Grantový projekt se zabývá analytickou charakterizací biologických vzorků pomocí hmotnostní spektrometrie s desorpcí/ionizací laserem za účasti i bez použití matrice, (MA)LDI, s důrazem na detekci přítomných nízkomolekulárních látek. Analyzovány budou vzorky potkaní moče, plazmy a tkání, v kterých bude studována distribuce a zastoupení vybraných léčiv a jejich metabolitů. Dále budou analyzovány vzorky lidských tkání (nádorové x zdravé) s cílem případné identifikace biomarkerů nádorového poškození. Po optimalizované přípravě vzorku budou jednotlivé vzorky charakterizovány zobrazovací technikou (MA)LDI-MS imaging, přičemž ze získaného dvourozměrného obrazu dostaneme informaci o přítomných sloučeninách, jejich množství a distribuci ve studovaných tkáních.Podpůrnou informaci přinese paralelní měření pomocí ultravysokoúčinné kapalinové chromatografie ve spojení s hmotnostní spektrometrií s ionizací za atmosférického tlaku, kde budou profilovány jednotlivé skupiny sloučenin s cílem jejich přesné identifikace na základě určení elementárního složení a charakteristické fragmentace.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
An important scientific contribution of the project is the developed methodology of liquid chromatography and matrix-assisted and matrix-free laser desorption/ionization mass spectrometry for the characterization of two important drugs, atorvastatin andtramadol in animal tissues. The results were published in two articles in prestigious journal Analytical and Bioanalytical Chemistry.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 7, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 31, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
3,390 thou. CZK
Public financial support
3,390 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
3 390 CZK thou.
Public support
3 390 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
CB - Analytical chemistry, separation
Solution period
01. 01. 2012 - 07. 12. 2015