All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Polyploidization as a key factor in genome evolution of basal vertebrates´ lineages

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Post-graduate (doctorate) grants

  • Call for proposals

    Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)

  • Main participants

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    P506-11-P596

Alternative language

  • Project name in Czech

    Polyploidizace jako klíčový faktor v evoluci genomu bazálních linií obratlovců

  • Annotation in Czech

    Dvojnásobné zdvojení genomu bazálních linií obratlovců patří k neobjasněným aspektům evoluce genomu. Stopy těchto 600-640 mil. let starých událostí jsou zastřeny následnými redukcemi genomu a duplikacemi arediploidizací již jen u některých skupin obratlovců (př. paprskoploutví). Jeseteři (Acipenseriformes) jsou nejrannější, velmi starobylou vývojovou divergencí paprskoploutvých, u nichž duplikace allopolyploidizací probíhá až dosud. Jejím výsledkem jsou 3 ploidní úrovně (4n, 8n, 12n; diploidní předek senedochoval). Jeseteři tak představují jedinečný model ke studiu evoluce genomu nejstarších obratlovců. Jsou unikátní tím, že jedinci různých ploidií ale i různých druhů se mezi sebou kříží a produkují fertilní potomstvo. Tento projekt navrhuje na jeseterech a jejich hybridech z chovu FROV JU přispět k řešení otázky paleo- a recentní ploidie, provést 1) cytogenetická mapování některých konzervativních genů (Hox, Sox), 2) testování hypotéz, že allopolyploidizaci umožňuje neexistence pohlavních chromozómůa 3) gene silencing (histonové modifikace) je jedním z mechanismů rediploidizace.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EG - Zoology

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    Within the project several methods of genomic in situ hybridization (GISH) and comparative genomic hybridization (CGH) in polyploid and highly polyploid hybrid fish have been successfully applied. The project yielded four publications, three of them published in highly recognized journals.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2011

  • Realization period - end

    Dec 31, 2013

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Jun 12, 2013

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP15-GA0-GP-U/02:2

  • Data delivery date

    May 6, 2016

Finance

  • Total approved costs

    2,246 thou. CZK

  • Public financial support

    2,246 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK