Polyploidization as a key factor in genome evolution of basal vertebrates´ lineages
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-11-P596
Alternative language
Project name in Czech
Polyploidizace jako klíčový faktor v evoluci genomu bazálních linií obratlovců
Annotation in Czech
Dvojnásobné zdvojení genomu bazálních linií obratlovců patří k neobjasněným aspektům evoluce genomu. Stopy těchto 600-640 mil. let starých událostí jsou zastřeny následnými redukcemi genomu a duplikacemi arediploidizací již jen u některých skupin obratlovců (př. paprskoploutví). Jeseteři (Acipenseriformes) jsou nejrannější, velmi starobylou vývojovou divergencí paprskoploutvých, u nichž duplikace allopolyploidizací probíhá až dosud. Jejím výsledkem jsou 3 ploidní úrovně (4n, 8n, 12n; diploidní předek senedochoval). Jeseteři tak představují jedinečný model ke studiu evoluce genomu nejstarších obratlovců. Jsou unikátní tím, že jedinci různých ploidií ale i různých druhů se mezi sebou kříží a produkují fertilní potomstvo. Tento projekt navrhuje na jeseterech a jejich hybridech z chovu FROV JU přispět k řešení otázky paleo- a recentní ploidie, provést 1) cytogenetická mapování některých konzervativních genů (Hox, Sox), 2) testování hypotéz, že allopolyploidizaci umožňuje neexistence pohlavních chromozómůa 3) gene silencing (histonové modifikace) je jedním z mechanismů rediploidizace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Within the project several methods of genomic in situ hybridization (GISH) and comparative genomic hybridization (CGH) in polyploid and highly polyploid hybrid fish have been successfully applied. The project yielded four publications, three of them published in highly recognized journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
2,246 thou. CZK
Public financial support
2,246 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK