Where does a species start and end? Speciation in a ring studied in the era of phylogenomics with application to European spined loaches
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 12 (SGA02012GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-12-P857
Alternative language
Project name in Czech
Kde začíná a končí druh? Speciace v kruhu evropských sekavců studovaná v éře fylogenomiky
Annotation in Czech
Přední otázkou studií speciace je zda mohou druhy vznikat bez přítomnosti geografických bariér. Unikátní příležitost studia takové divergence nabízí druh(y) žijící v kruhu, kde reprodukčně izolované koncové populace jsou propojeny postupnou variabilitouokolo geografické bariéry. V projektu nabízíme nový model sladkovodních populací ryb žijících v kruhu: kryptický druhový komplex sekavců obklopující Černé moře. Hlavními cíli projektu je použít nejmodernější metody fylogenomiky a získat informaci o prostorové genetické variabilitě napříč genomy sekavců k objasnění role historických evolučních sil, které by mohly být zodpovědné za současnou genomickou architekturu podél kruhu. Využití mnoha genetických markerů nám pomůže definovat populační jednotky a stádia speciace napříč populacemi. Navíc, éra genomiky otevírá nové příležitosti k identifikaci kandidátních speciačních mechanismů k porozumění, jak populace divergují a dávají vznik novým druhům, a dále, zda divergence za pokračujícího toku genů je možnáči dokonce běžná.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
EH - Ecology - communities
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
In this project, speciation processes in spined loaches complex around the Black Sea have been evaluated. This is an interesting topic, since asexual reproduction and hybridization occurs in this group. High quality data was obtained within the project and several important collaborations with foreign experts have been established. Two papers (with project dedication) have been already published.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 19, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
2,668 thou. CZK
Public financial support
2,668 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK