Global and transcript-specific analysis of translational control in disease.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Grant projects of excellence in basic research EXPRO
Call for proposals
Grantové projekty excelence v základním výzkumu EXPRO (SGA0201900004)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-25821X
Alternative language
Project name in Czech
Regulace translace v nemoci na globální i transcript-specifické úrovni.
Annotation in Czech
Regulace genové exprese je srdcem všeho života. Mimo jiné jí může být dosaženo na úrovni translace genetické informace z mRNA do proteinů. Výsledky dokazující mimořádnou důležitost exaktní regulace translace jsou zcela zásadní, neboť i malé narušení časování anebo přesnosti translace specifických mRNA způsobuje nebo doprovází mnoho lidských onemocnění. Proto není překvapující, že geny kódující translační faktory jsou často deregulovány např. během onkogeneze. Jako příklad uvádíme multifunkční, mnohapodjednotkový eIF3. Abychom objasnili zapojení eIF3 do onkogeneze, zanalyzujeme všechny změny translatomu v buňkách, ve kterých byla změněna hladina eIF3 na úrovni celého transkriptomu pomocí tzv. 80S ribosome profiling. Dále pak vyvineme a budeme aplikovat nové varianty metody ribosome profiling pro: 1) sledování změn tzv. "footprints" 40S podjednotky jak v 5 'UTR, tak kolem start/stop kodonů, a pro 2) sledování dynamiky vybraných translačních faktorů v rámci celého transkriptomu u kvasinek a savců. Dále budeme studovat mechanismus translační kontroly ATF4 za různých stresů s úlohou eIF3.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Apr 20, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GX-R
Data delivery date
May 21, 2024
Finance
Total approved costs
45,840 thou. CZK
Public financial support
45,840 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK