Evaluation of Electrophoretograms using Image Analysis

Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—

Project name in Czech
Vyhodnocování elektroforetogramů pomocí analýzy obrazu
Annotation in Czech
Cílem projektu je kvantitativní vyhodnocování jednorozměrných (1D) a dvourozměrných (2D) elektroforetogramů pomocí analýzy obrazu. Metoda bude založena na mikropočítačovém systému LUCIA I, který je k dispozici. Vyvíjené doplňkové programové vybavení budeu 1D separací umožňovat mj. filtraci šumu, rozklad profilů s překrývajícími se pásy na jednotlivé vrcholy, určení přesné polohy pásů a jejich integraci s možností dalších výpočtů (molárních hmotností atd.), u 2D separací normalizaci profilů, odstranění pozadí, určení polohy skvrn, jejich integraci, srovnání různých gelů, vzájemné odečítání obrazů, tvorba obrazových databází aj. Při tvorbě programového vybavení se bude užívat různých metod matematické morfologie a statistiky. Systém bude využit hlavně kměření přesnosti translace a ke studiu alterací ribozomálních bílkovin v průběhu diferenciace streptomycet, možnosti využití jsou však mnohostranné (nejen pro elektroforézu).

R&D category
—
CEP classification - main branch
9F - 9
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
—

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1995/AV0/AV05IA/V/1:1
Data delivery date
—

Similar projects(10)