Spatial statistics of 3D confocal images of capillary network
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 5 (SAV02005-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA100110502
Alternative language
Project name in Czech
Prostorová statistika 3D konfokálních snímků krevních vlásečnic
Annotation in Czech
Cílem je stanovení prostorové hustoty délky a charakterizace prostorového uspořádání krevních vlásečnic v mozku ze sérií snímků optických řezů pořízených laserovým rastrovacím konfokálním mikroskopem. Snímky budou podle potřeby zvýrazněny dekonvolucí, složeny horizontálně nebo vertikálně ze zorných polí. Bude vyvinuto několik metod detekce vlásečnic, délka vlásečnic bude automaticky změřena a výsledky budou porovnány se současnými interaktivními metodami měření délky. Pro detekci budou použity metody prahování zvýrazněného obrazu, hledání minimálních cest a pravděpodobnostní metody s Markovskými náhodnými poli vektorů. Prostorové uspořádání bude charakterizováno topologií vlásečnic, korelačními funkcemi, rozdělením vzdáleností od vlásečnic a rozdělenímsměrů vlásečnic.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BB - Applied statistics, operational research
CEP - secondary branch
JC - Computer hardware and software
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10103 - Statistics and probability<br>20206 - Computer hardware and architecture
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Methods of detection and measurement of length, anisotropy, tortuosity and connectivity of fibre like biological structures were developed. Variance of estimates of volume, surface area and length using intersections with spatial grids was calculated.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-AV0-IA-U/01:1
Data delivery date
Jun 8, 2010
Finance
Total approved costs
1,805 thou. CZK
Public financial support
1,805 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK