Hemicatenated DNA loops: their occurence in humen genome and recognition by tumor suppressor protein p53
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA400040702
Alternative language
Project name in Czech
Hemikatenátové smyčky DNA: jejich výskyt v lidském genomu a rozpoznávání nádorově supresorovým proteinem p53
Annotation in Czech
Výsledky mapování lidského genomu vedou k závěru, že sekvence DNA kódující proteiny představují pouze ~ 3% lidského genomu. Alternativní struktury DNA jsou zajímavé jako potenciální signální místa označující významné oblasti genomu. CA-mikrosatelity jsourepetitivní sekvence poly (CA).poly(TG), které se vyskytují ve všech eukaryotních genomech. Tyto (i jiné) sekvence jsou schopny vytvářet in vitro různě dlouhé smyčky (DNA loop) stabilizované hemikatenanem (hcDNA). hcDNA je specificky rozpoznávána proteinem HMGB1, který je významný pro transkripci, opravu DNA, rekombinaci, buněčnou signalizaci, růst nádorů a metastáz. Nedávno jsme prokázali, že nádorově supresorový protein p53 specificky rozpoznává hcDNA [Štros, M. et al. (2004) Biochemistry 43,7215-7225]. Hlavním cílem projektu je pokusit se o důkaz existence hemikatenanů v lidském genomu a objastnit biologický význam interakce p53 s hcDNA pro funkci tohoto proteinu při indukci apoptózy a zástavy buněčného cyklu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
FD - Oncology and haematology
CEP - another secondary branch
FR - Pharmacology and apothecary chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30104 - Pharmacology and pharmacy<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The ability of HMGB1 to promote catenation and decatenation of circular DNA by topoisomerase IIalpha was shown. A method for preparation of DNA hemicatenanes was developed. An extreme affinity of HMGB1 and p53 for DNA hemicatenanes was demonstrated.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 9, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Jun 28, 2013
Finance
Total approved costs
2,428 thou. CZK
Public financial support
2,428 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK