DNA labeling with redox markers for electrochemical sensing. Applications in analysis of nucleotide sequences and molecular diagnostics
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA400040901
Alternative language
Project name in Czech
Značení DNA redoxními markery pro elektrochemickou detekci. Aplikace v analýze nukleotidových sekvencí a v molekulární diagnostice.
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na vývoj nových technik značení DNA a jejich využití v elektrochemické analýze DNA a při konstrukci biosenzorů. Značení DNA bude založeno na (1) syntéze konjugátů nukleosid trifosfátů (modifikovaných na nukleobázi) s redox-aktivními skupinami pomocí cross-coupling reakcí ve vodném prostředí a (2) jejich inkorporaci do DNA pomocí enzymů. Bude vypracována metodika konstrukce DNA sond značených ve specifických pozicích. Budou zkoumány elektrochemické vlastnosti modifikovaných nukleotidůa nukleových kyselin a vliv struktury DNA na elektrochemické odpovědi konjugovaných značek. Na základě tohoto výzkumu budou vybrány značky a analytické postupy vhodné pro efektivní analýzu nukleotidových sekvencí, se zaměřením na aplikace v molekulární diagnostice závažných onemocnění. Značené nukleové kyseliny budou využity při vývoji nových biosenzorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CG - Electrochemistry
CEP - secondary branch
CC - Organic chemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Methodology for DNA redox labeling was developed based on synthesis of modified dNTP and their enzymatic incorporation. Electroanalysis of labeled DNA was optimized and new methods proposed for analysis of DNA sequences and interactions with proteins.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-AV0-IA-U/01:1
Data delivery date
Apr 14, 2014
Finance
Total approved costs
9,985 thou. CZK
Public financial support
9,985 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK