Interaction of biopolymers with ligands and detection of their conformation changes at interfaces by electrochemical and optical methods
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 4 (SAV02004-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Interakce biopolymerů s ligandy a detekce jejich konformačních změn na fázových rozhraních pomocí elektrochemických a optických metod
Annotation in Czech
Samouspořádané vrstvy bazí nukleových kyselin, nukleosidů, neukleotidů, alkylthiolů, kvarterních amonných solí a fosfolipidů adsorbovaných na povrchu rtuti, grafitu, křemíku a jiných vodivých a polovodivých površích budou studovány, elektrochemickou impedanční spektroskopií, Ramanovou spektroskopií, difrakčním optickým sensorem (DOE), rtg reflektometrií, a AFM mikroskopií. Nedávno byl DOE sensor použit k povrchové strukturní charakteristice uhlíkových elektrod (skelný uhlík, pyrolytický frafit) modifikovaných vrstvou rtuti. Interakce mezi adsorbovanými bazemi mohou vést k jejich dvojrozměrné (2-D) kondenzaci a tvorbě kompaktní vrstvy. Bude studován vliv morfologie chemicky modifikovaných povrchů na tvorbu a vlastnosti kompaktních vrstev složek nukleových kyselin a fosfolipidů. Bude sledována závislost adsorpce biopolymeru na jeho konformaci a vliv mechanických vlastností povrchu elektrody a elektrického pole rozhraní elektroda-roztok na adsorpci a 2-D kondenzaci.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CG - Electrochemistry
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
CB - Analytical chemistry, separation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10406 - Analytical chemistry<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The effect of physical properties of the electrode surface on the sensitivity of detection of oligodeoxynucleotides in the presence of Cu(II) ions, determination of their lenght and ratio purine/pyrimidine units in the ODN chain was determined.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-AV0-IA-U/03:3
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
1,965 thou. CZK
Public financial support
1,965 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK