Using of the fast electrophoretic separation with the high sensitive fluorometric detection for the identification of micro-organisms
Project goals
The identification of micro-organisms requires usually the long time of analysis. The use of the efficient electrophoretic techniques for the separation and identification of micro-organisms is the possible solution for the fast nicrobiological analysis.The separation techniques employing fluorescence detection are sensitive and selective so they are often applied for the trace analysis of biological samples. The project suggests the use of the fluorescent amphiphilic compounds for the detection of biopolymers on the basis of their mutual interactions in the separation medium which leads to formation of soluble and detectable aggregates. Our preliminary experiments show possibility to the dynamic modificatin of proteins for UV and fluorometric detection (amol) in CZE. Therefore we suppose the positive results of this project in thze area of the fast, including proteomic, identification of microorganisms without previous isolation with the final aim of the analyses of real samples.
Keywords
efficient electrophoretic techniquesdynamic modificationoptical detectionfast identification of microorganismsbiopolymersanalyses of real samples
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 3 (SAV02003-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Využití rychlé elektroforetické separace s velmi citlivou fluorimetrickou detekcí pro identifikaci mikroorganismů
Annotation in Czech
Metody užívané k detekci a identifikaci mikroorganismů jsou zpravidla značně časově náročné. Užití účinných elektroforetických technik pro separaci, identifikaci a kvantifikaci mirkoorganismů je možným řešením pro dosažení rychlé mikrobiální analýzy. Přistopové analýze biologických vzorků se s úspěchem využívá fluorescenční detekce pro její citlivost a selektivitu. Projekt předpokládá využití barevných amfifilních látek pro detekci biopolymerních analytů na základě jejich vzájemných interakcí v separačním mediu, což vede ke vzniku rozpustných detegovatelných agregátů. V předchozích pracech jsme použili dynamické modifikace proteinů pro UV a fluorimetrickou detekci v kapilární zonové elektroforéze. Nízká met detekce (amol) při použití fluorescenčního modifikátoru je předpokladem úspěšného řešení projektu v oblasti rychlé identifikace mikroorganismů, včetně proteomické, bez předchozí izolace a namnožení čistých kultur, s konečným cílem využití této techniky při analýze reálných vzorků.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Capillary electromigration techniques were optimized for the rapid separation, sensitive detection and identification of the dynamically modified microbes (cultured or from real sample) by colored amphiphilic compounds,new pI markers were synthesized.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-AV0-IA-U/03:3
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
9,332 thou. CZK
Public financial support
3,746 thou. CZK
Other public sources
3,724 thou. CZK
Non public and foreign sources
1,862 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
9 332 CZK thou.
Public support
3 746 CZK thou.
40%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
CB - Analytical chemistry, separation
Solution period
01. 01. 2003 - 01. 01. 2006