All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Structural study of protein domains of monkey retrovirus

Public support

  • Provider

    Academy of Sciences of the Czech Republic

  • Programme

    Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic

  • Call for proposals

    Výzkumné granty 3 (SAV02003-A)

  • Main participants

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    IAA4055304

Alternative language

  • Project name in Czech

    Strukturní studie proteinových domén opičího retroviru

  • Annotation in Czech

    Sbalování nezralých virových částic a jejich uvolňování a zrání jsou u Mason-Pfizerova opičího viru časově i prostorově oddělené děje. Díky tomu je tento retrovirus, který způsobuje syndrom podobný AIDS u makaků, vhodným experimentálním modelem pro studium sbalování kapsid a procesu jejich zrání. V tomto projektu navrhujeme studovat trojrozměrnou strukturu 13 kDa formy proteasy (PR) a proteinu p12, který hraje roli při sbalování kapisd pomocí izotopově značené NMR spektrometrie. Důraz bude kladen na určení vlivu C-koncové extense molekuly proteasy na její strukturu a aktivitu. Proto bude stanovena struktura 13 kDa formy a porovnána s další formou vznikající při autokatalytickém štěpení tj. 12 kDa formou PR, jejíž 3D strukturu v současnosti dokončujeme.Zároveň bude sledován vliv zkracování molekuly proteasy na životní cyklus viru a uvolňování proteasy z prekursorů v závislosti na hladině jejich exprese v savčích buňkách.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    CE - Biochemistry

  • CEP - secondary branch

  • CEP - another secondary branch

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    We solved the high resolution structure of M-PMV protease and M-PMV NC dUTPase using NMR and crystallography. We identified the structural motifs important for inhibitor binding to M-PMV integrase.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2003

  • Realization period - end

    Dec 1, 2007

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Feb 27, 2007

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP08-AV0-IA-U/02:2

  • Data delivery date

    Jun 28, 2013

Finance

  • Total approved costs

    11,354 thou. CZK

  • Public financial support

    4,282 thou. CZK

  • Other public sources

    7,072 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK