A Combined QM/MM Calculations of Metal-Peptide Interactions
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Kombinované QM/MM výpočty interakcí přechodných kovů s peptidy.
Annotation in Czech
Cílem projektu je vyhodnotit afinitu jednotliv_ch aminokyselin, pţedev_ím jejich postranních ţet+zců, k vybraným přechodným kovům (Co, Ni, Cu, Zn, Cd, Hg). Výpočetní metody a prostředky, které jsou k dispozici, umožňují stanovit interakční energie s přesností blížící se experimentálním hodnotám. Tyto hodnoty mohou sloužit pro celé spektrum vědeckých pracovníků zabývajících se interakcemi kovů s biologickým materiálem či teoretikům snažícím se sestavovat empirické potenciálové funkce pro přechodné kovy.Pro nás budou sloužit jako vstup do druhé části projektu a tou je návrh struktury peptidů, které mohou dané kovy selektivně vázat. Z experimentálních studií je známo, že dostatečně dlouhé peptidy či proteiny jsou schopny selektivně vázat kovy. Tudíž kombinací preferované koordinace kovu a jeho rozdílné afinity k různým aminokyselinám se sterickými požadavky navržených peptidů by mohlo býti docíleno této selektivity.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Použitím metod teor. chemie byly vypracovány výpočetní postupy poskytující velmi přesné hodnoty interakčních energií přechodných kovů s modelovými funkčními skupinami a násl. byla vyhodnocena afinita aminokyselinových residuí k vybraným kovům.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1998
Realization period - end
Jan 1, 1999
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2000/AV0/AV00IA/U/6:3
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,915 thou. CZK
Public financial support
391 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK