New tools in molecular genetics of cyanobacteria - applications in exploration of the chlorophyll biosynthetic pathway
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA500200713
Alternative language
Project name in Czech
Nové nástroje v molekulární genetice sinic - využití ve výzkumu biosyntetické dráhy chlorofylu
Annotation in Czech
Sinice Synechocystis je modelovým oraganismem pro studium fotosyntézy. Z nástrojů molekulární genetiky běžných u prokaryotních modelů je u sinic nedostatek vhodných expresních vektorů s indukovatelnými promotory a zcela chybí možnost podmíněné inaktivacegenů, které nemohou být deletovány z důvodu jejich nepostradatelnosti(conditional knockout). Cílem projektu je: 1) Vytvořit systém pro regulovanou expresi vlastních i cizích proteinů v této sinici. Tento systém bude založen na plasmidu s vysokým počtemkopií (spontánní mutant nativního plasmidu) s využitím regulovatelných promotorů z E. coli a sinic. 2) Vytvořit systém pro podmíněnou inaktivaci genů založený na antisense RNA či na TetR represoru nebo nirA promotoru. 3) Demonstrovat užitečnost těchto systémů ve výzkumu biosyntetické dráhy chlorofylu, zvláště v její regulaci a v koordinaci se syntézou apoproteinů. Tři klíčové enzymy této dráhy budou overexprimovány nebo podmíněně inaktivovány na pozadí různých mutantů Synechocystis.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
We have constructed several tools for regulatable expression and for conditional gene inactivation in cyanobacteria. Using these tools we have studied the role of key proteins in chlorophyll and heme biosynthesis, particularly the role of ferrochelatase.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-AV0-IA-U/01:1
Data delivery date
Jun 8, 2010
Finance
Total approved costs
2,423 thou. CZK
Public financial support
2,423 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK