Improvement of the long-term expression and anti-methylation protection of RSV based retroviral vectors
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Zlepšení dlouhodobé exprese retrovirových vektorů a jejich ochrana před metylační supresí
Annotation in Czech
Virus Rousova sarkomu (RSV), kuřecí retrovirus transdukující onkogen v-src, je po integraci do genomu heterologní savčí buňky preferenčně inaktivován na transkripční úrovni. Pravděpodobnou příčinou této inaktivace je methylace provirové DNA, přičemž kritická je methylace regulačních sekvencí soustředěných v tzv. dlouhých koncových repetických (LTR). Stejně jako RSV se chovají vektory konstruované na jeho basi, což znemožňuje jejich použití pro transfer genů do savčí buňky. Recentně jsme ověřili, že proviry řízené RSV LTR mohou být chráněny před methylací a inaktivací v blízkosti ostrovů CpG. Chtěli bychom využít tohoto poznatku a inserovat do provirové DNA minimální sekvence ostrova CpG a vytvořit tak vektor na basi RSV vhodný pro savčí buňky. RSV se vbuňkách savců nereplikuje, nemůže rekombinovat s endogenními viry a nemůže produkovat infekční virus. Těmito pokusy rovněž získáme informace o konkrétních dinukleotidech CpG, jejichž methylace podmiňuje inaktivaci, a o citlivosti LTR.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
FD - Oncology and haematology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
N - Nesplněno zadání
Project results evaluation
We have shown that retroviral LTRs without CpG dinucleotides ensure long-term expression of integrated vectors and protect them from DNA methylation and transcriptional silencing. The results haven't been published yet.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/AV0/AV05IA/U/N/5:3
Data delivery date
Sep 26, 2007
Finance
Total approved costs
1,743 thou. CZK
Public financial support
1,646 thou. CZK
Other public sources
97 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK