The analysis of gene coding regions of the maxicircle DNA of Trypanoplasma borreli and Cryptobia helicis (Bodonida)

Provider

Academy of Sciences of the Czech Republic

Programme

Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic

Call for proposals

—

Main participants

Parazitologický ústav AV ČR

Contest type

—

Contract ID

—

Project name in Czech

Analýza kódující oblasti maxikroužkové DNA prvoků Trypanoplasma borreli a Cryptobia helicis (Bodonida)

Annotation in Czech

Naším cílem je pokračovat v analýze maxikroužkové DNA T. borreli, která dosud prokázala jedinečnou strukturu kinetoplastové DNA, neobvyklé uspořádání genů a distribuci editingu. Budeme sekvencovat oblast sousedící s 3 koncem genu cytochromoxidázové podjednotky II a budeme analyzovat rozsah editingu příslušných transkriptů. Sekvenování genu pro SS rRNA C. helicis umožní stanovit fylogenetickou pozici tohoto druhu v rámci kinetoplastid a určit evoluční vzdálenost od morfologicky blízce příbuzného druhu T.borreli, který má však odlišnou strukturu kinetoplastu. Analýza maxikroužkové DNA C. helicis ukáže, zda se tento rozdíl odráží i v odlišném uspořádání genů a editačních vzorcích. Studium těchto primitivních bodonidů by mohlo významně přispět k objasňování evolučních kořenů procesu editování RNA.

R&D category

—

CEP classification - main branch

EB - Genetics and molecular biology

CEP - secondary branch

EG - Zoology

CEP - another secondary branch

—

OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics

Realization period - beginning

Jan 1, 1995

Realization period - end

Jan 1, 1997

Project status

K - Ending multi-year project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP/1997/AV0/AV07IA/V/9:4

Data delivery date

—

Total approved costs

712 thou. CZK

Public financial support

712 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK