Inducible DNA repair in Arabidopsis thaliana
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium indukované reparace DNA u Arabidopsis thaliana
Annotation in Czech
Rostliny brání integritu DNA proti genotoxickému působení účinnou reparací. Před nedávnem bylo prokázáno, že za jevem adaptace k poškození chromosomů mutageny odpovídá excizní reparace poškozených bazí DNA. Součástí této reparační dráhy je i polymerasa beta (Pol beta) a poly(ADP-ribose) polymerasa (PARP), která je i součástí rozhodovacího mechanismu spouštění apoptosy. V navrhovaném projektu chceme využít komerčně dostupné možnosti vyhledat pomocí PCR linie Arabidopsis s inserčně mutovanými geny Pol beta a PARP, protože jejich velikost zajišťuje přinejmenším 80 % pravděpodobnost, že mutace nastala v kódující oblasti. Linie budou charakterizovány a bude u nich testována citlivost k poškození DNA při různých režimech adaptace. metodou komet bude zjišťována schopnost reparovat poškození DNA nebo indukovat apoptosu. Těmito pokusy chceme zodpovědět otázku, zda si tyto pro jiné organismy klíčové geny zachovávají stejnou úlohu a nebo zda rozsliny mají alternativní způsob opravy poškozené DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Thirteen Arabidopsis knockout mutants in various repair pathways demonstrated that nearly instant sealing of double strand breaks is the most effective and efficient repair pathway independent on mutation and tissue studied.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-AV0-IA-U/04:2
Data delivery date
Sep 26, 2007
Finance
Total approved costs
3,765 thou. CZK
Public financial support
1,814 thou. CZK
Other public sources
1,951 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK