Application of combinatorial libraries of affinity carriers for the identificatio of new interactions of the protein-ligand type
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
SAV0-AB2000
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Použití kombinatorických knihoven afinitních nosičů za účelem identifikace nových interakcí typu protein-ligand
Annotation in Czech
Navrhujeme novou metodu pro identifikaci nových doposud neznámých interakcí mezi různorodými proteiny a ligandy. Princip metody je založen na interakci směsí imobilizovaných ligandů (řady afinitních nosičů) se směsmi proteinů přítomných v surových homogenátech ze savčích tkání. Zamýšlíme připravit kombinatorické knihovny imobilizovaných fosfinových pseudopeptidů, které budou použity pro afinitní vázání specifických proteinů. Navázané proteiny budou eluovány a analyzovány. Následovný iterativní proces (chemická syntéza podknihoven) by měl vést k identifikaci jedinečného ligandu pro vybraný protein. Tento ligand by měl být, v ideálním případě, potentním a selektivním modulátorem funkce daného proteinu. Pro identifikaci interakce protein-ligand tak není potřebná žádná předchozí informace o charakteru daného proteinu. Tato metoda může být rovněž nástrojem pro isolaci proteinu nového, doposud neznámého.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Podařilo se vyvinout novou metodu založenou na principu afinitní chromatografie sloužící k vyhledávání specifických proteinů pro ligandy připravené ve formě kombinatorických knihoven. Byly připraveny vysoce selektivní inhibitory lidského enzymu BHMT.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2002
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2003/AV0/AV03IA/U/N/5:3
Data delivery date
Oct 27, 2004
Finance
Total approved costs
2,242 thou. CZK
Public financial support
1,384 thou. CZK
Other public sources
858 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK