New approaches for study of protein structure by means of vibrational spectroscopy
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 6 (SAV02008-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB101120805
Alternative language
Project name in Czech
Nové přístupy ke studiu struktury proteinů pomocí vibrační spektroskopie
Annotation in Czech
Určení struktury proteinů představuje jednu z klíčových úloh současné molekulární biologie. Je zde naléhavá potřeba třídimenzionálních struktur proteinů pro pochopení jejich role v organizmech a pro efektivní návrh léčiv. Hlavním cílem projektu je vývojnové metodiky pro stanovení obsahu sekundárních struktur proteinů pomocí vibrační spektroskopie (Ramanova spektroskopie, Ramanova optická aktivita, Ramanova spektroskopie kapkově nanášených povlaků, Fourierova infračervená spektroskopie, Fourierova infračervená spektroskopie se zeslabenou totální reflexí). Pro každou metodu bude změřena nová rozsáhlá spektrální referenční sada, budou implementovány stávají metody a nové metody (založené na multivariační statistice) s vyšším informačním obsahem, např. určením počtu strukturních segmentů, či sbalení atd. Vyvinuté metody budou volně k dispozici a mohou být aplikovány v dalším proteinovém výzkumu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Approaches for study of protein structures in solvents, glass phase and crystals by vibrational spectroscopy were created; as well as for determination of concentration by Raman spectroscopy. The usage of methods with emphasis of DCDR was demonstrated.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 9, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Jun 14, 2011
Finance
Total approved costs
1,622 thou. CZK
Public financial support
1,622 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK