Molecular mechanism of the photolysis of water during photosynthesis studied by mathematical modeling
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 7 (SAV02009-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB401370904
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární mechanismus fotolýzy vody ve fotosyntéze studovaný pomocí matematického modelování
Annotation in Czech
Fotolýza vody na donorové straně fotosystému II (PSII) je unikátní proces, jehož pochopení může zásadním způsobem přispět k využití vody co by alternativního energického zdroje. Molekulární mechanismus fotosyntetické fotolýzy vody nebyl dosud zcela objasněn. K pochopení tohoto složitého procesu významně přispívají i teoretické přístupy (Jablonský a Lazár, 2008, Biophys. J. 94:2725-2736). Cílem projektu bude detailně prozkoumat vliv kofaktorů, heterogenity thylakoidní membrány a dimerového uspořádání PSII na fotolýzu vody pomocí teoretických simulací a měření vývinu kyslíku. Z předběžných výsledků plyne, že zmíněné cíle není možné splnit bez sestavení detailnějších matematických modelů PSII a řešení soustav až tisíců diferenciálních rovnic (model dimeruPSII) s vysokými nároky na hardware (víceprocesorový počítač) i software (paralelní běh simulací). Pomocí nových matematických modelů se stabilním řešením hodláme fitovat tyto modely na experimentální data a testovat pracovní hypotézy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
Terminated early - principal investigator terminaded his employment
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
S - Stopped (prematurely terminated) multi-year project
Latest support payment
Mar 9, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Jun 14, 2011
Finance
Total approved costs
861 thou. CZK
Public financial support
834 thou. CZK
Other public sources
27 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK