Evolution of sex chromosome gene content in heterogametic male and female organisms: bioinformatic approach
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 5 (SAV02007-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB501110701
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce pohlavních chromozomů u organismů s heterogametickými samci a heterogametickými samicemi: bioinformatický přístup
Annotation in Czech
Homogametické pohlavní chromozomy, X a Z, hrají mimořádnou roli v několika významných evolučních procesech jako jsou pohlavní výběr nebo speciace, a proto bylo vynaloženo velké úsilí na charakterizaci jejich genového obsahu. Většina studií zabývajících se chromozomem X, homogametickým pohlavním chromozomem u organismů s heterogametickými samci, objevila nenáhodný obsah genů s preferenční či výlučnou expresí v jednom pohlaví. Stále však není jasné, jaké selekční tlaky jsou za tento jev odpovědné. Cílem tohoto projektu je analyzovat obsah genů na chromozom Z u kura domácího (Gallus gallus), tj. organismu s heterogametickými samicemi, a porovnat ho s genovým obsahem chromozomu X. Za tímto účelem bude zpracováno několik datových souborů týkajích se expresegenů, která zahrnují jednak věřejně dostupná data a jednak data získaná během projektu pomocí DNA čipů. Získané poznatky by mohly pomoci rozhodnout, jaké selekčních tlaky vedou k nenáhodnému obsahu genů na pohlavních chromozomech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Results provided new insight into the mechanisms affecting sex chromosome gene content in birds and mammals. These mechanisms include sexually antagonistic selection, epigenetic modifications of the sex chromosomes and interspecific gene flow.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 28, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-AV0-KJ-U/03:3
Data delivery date
Jun 14, 2011
Finance
Total approved costs
964 thou. CZK
Public financial support
964 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK