Transcriptome of the exo70A1 mutant and cellular roles of EXO70A1, a putative subunit of the exocyst complex, in Arabidopsis thaliana
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 6 (SAV02008-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB600380802
Alternative language
Project name in Czech
Transkriptom mutanta exo70A1 a buněčné funkce EXO70A1, předpokládané podjednotky komplexu exocyst, u Arabidopsis thaliana
Annotation in Czech
Komplex exocyst se v buňce účastní finálních kroků exocytózy. Vzhledem k odlišnostem živočišných a kvasinkových buněk, kde byl doposud studován, od buňky rostlinné můžeme u rostlin předpokládat i řadu rozdílných funkcí. O významu komplexu exocyst u rostlin svědčí například dramaticky změněný fenotyp mutantů Arabidopsis v genu EXO70A1 kódujícím velmi pravděpodobně jednu z osmi podjednotek tohoto komplexu. Na popis mutantů exo70A1, který jsme provedli v rámci předchozího výzkumu, bychom chtěli navázat jejich detailnější analýzou. Zejména analýza kompletního transkriptomu mutantů exo70A1 pomocí tzv. DNA čipu jistě odhalí interagující geny a ukáže na další možné funkce EXO70A1. Tento projekt by měl přispět pomocí molekulárně biologických a mikroskopickýchtechnik (např. imunolokalizace, GFP fúze, farmakologie) k detailnějšímu poznání role EXO70A1, resp. exocystu, v rostlinné buňce.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EA - Morphology and cytology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
EXO70A1, an exocyst subunit, is localized to maturating cytokinetic walls during cytokinesis. It interacts with NOI6 modulating response to pathogens. The exo70A1 mutant shows defects in cytokinesis and shoot meristem, and changes in gene transcription.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 9, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Jun 14, 2011
Finance
Total approved costs
732 thou. CZK
Public financial support
732 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK