Population structure and species delimitation within the Trapeliopsis glaucolepidea agg. based on multigene DNA-sequence data
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 1 (SAV02003-XJ)
Main participants
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Populační struktura a odlišení druhu v rámci Trapeliopsis glaucolepidea agg. založené na multigenovém přístupu DNA-sekvencí
Annotation in Czech
Trapeliopsis glaucolepidea je lišejník vyskytující se kromě stř. a SZ Evropy také v horách tropické části střední a Jižní Ameriky a vých. Afriky. Variabilita druhu je velká a je velmi obtížné na základě kvantitativních rozdílů hovořit, zda-li se jedná pouze o fenotypický projev vyvolaný vlivem prostředí nebo zdali jsou změny geneticky fixované. Molekulární analýza relativně variabilních úseků sekvencí 3 různých loků 2 genomů (ITS a IGS rDNA, mtLSU) na rozsáhlém souboru vzorků zahrnujících víceméně rovnoměrně celý areál druhu by měla po vzájemném srovnání v rámci a mezi vytyčenými arelami přinést informace o tom, zda-li některé populace již tvoří oddělené linie a jedná se již o druhy nebo zda-li probíhá i nadále k genovému toku. Uvedené spacery a geny mají poměrně velký potenciál variability a bude tudíž možné po náležitém zpracování sekvencí zhodnotit na základě distribuce jednotlivých haplotypů průběh evolučních procesů v této skupině.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Tpsis glaucolepidea agg. is a variable but monophyletic group composed of genetically closely related lineages, some perhaps forming microspecies. DNA data indicate contiguous range expansion/fragmentation rather than an accidental historical event
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-AV0-KJ-U/07:5
Data delivery date
Feb 12, 2014
Finance
Total approved costs
1,105 thou. CZK
Public financial support
1,018 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK