Genetic consequences of population decline in Eurasian otter (Lutra lutra) populations in the Czech and Slovak Republics
Project goals
The Eurasian otter (Lutra lutra) is one of the large vertebrate species which underwent significant population decline over the past century. In populations in the Czech and Slovak Republics, this recent population decline was documented also through genetic evidence. The aim of the proposed project is analysis of present and past microsatellite DNA variability in Czech and Slovak otter populations, and assessment of genetic consequences of the recent population decline. We will focus on detection of recent and ancient population bottlenecks, assessment of present and past effective population size and analysis of population genetic structure. The project will be based on analysis of DNA extracted from tissue samples from otter carcasses (contemporarypopulation) and DNA extracted from teeth from skulls and other material from museum collections (historic population). The results will be used in conservation management.
Keywords
otterLutra lutramicrosatelliteshistoric DNApopulation declinebottleneckconservation geneticspopulation genetics
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 6 (SAV02008-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB600930804
Alternative language
Project name in Czech
Vliv poklesu početnosti vydry říční (Lutra lutra) na genetickou variabilitu populací v České a Slovenské republice
Annotation in Czech
Vydra říční (Lutra lutra) patří mezi druhy velkých obratlovců, které prošly v průběhu minulého století výrazným poklesem početnosti. U populací v České a Slovenské republice jsme recentní pokles početnosti detekovali také na základě genetických dat. Cílem navrhovaného projektu je studium současné a historické variability mikrosatelitové DNA české a slovenské populace vydry říční a zjištění genetických důsledků recentního poklesu početnosti. Pozornost bude zaměřena na detekci recentních a historických populačních bottlenecků, odhad současné a historické efektivní velikosti populací a analýzu populačně-genetické struktury. Projekt bude založen na analýze DNA izolované z tkání uhynulých jedinců (současná populace) a DNA izolované ze zubů lebek a dalšího materiálu z muzejních sbírek (historická populace). Výsledky budou využity v ochranářském managementu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10613 - Zoology
10614 - Behavioral sciences biology
10615 - Ornithology
10616 - Entomology
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Analysis of microsatellite DNA from Eurasian otter museum samples revealed earlier dating of recent population decline than based on available literature. Analyses of present populations confirmed gradual reconnection of the Czech and Slovak population.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2011
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 18, 2011
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP12-AV0-KJ-U/01:1
Data delivery date
May 25, 2012
Finance
Total approved costs
1,993 thou. CZK
Public financial support
1,993 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
1 993 CZK thou.
Public support
1 993 CZK thou.
100%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
EG - Zoology
Solution period
01. 01. 2008 - 31. 12. 2011