Genetic variability in populations of snow algae Chloromonas spp. (Chlorophyta): isolation by distance and effect of environmental factors
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 3 (SAV02005-J)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB601110509
Alternative language
Project name in Czech
Genetická variabilita populací sněžných řas z rodu Chloromonas (Chlorophyta): vliv geografické vzdálenosti lokalit a faktorů prostředí
Annotation in Czech
Sněžné řasy vyžadují pro růst velmi specifické podmínky. Vhodné lokality jsou často izolovány a úspěšné šíření větrem je závislé na náhodě. Vzdálenost lokalit tak může být zásadním faktorem ovlivňujícím genetickou variabilitu populací. U druhů, které sevyskytují v různých habitatech (jehličnatý les vs. bezlesí), by mohla hrát roli i selekce genotypů adaptovaných na určité podmínky prostředí. Cílem práce je zmapovat genetickou variabilitu českých a slovenských populací dvou běžných druhů z rodu Chloromonas, C. nivalis a C. brevispina. Otázkou je, jakým způsobem se na genetické fragmentaci podílí vzdálenost lokalit a vliv gradientu faktorů prostředí. Kromě toho budou objasněny fylogenetické vztahy evropských a severoamerických kmenů. K získání výsledkůvyužijeme analýzu variability různých oblastí genomu, které se liší mutační rychlostí (introny ypt4 a act, oblast ITS, 18S rDNA). Projekt by měl přispět k lepšímu porozumění původu sněžných řas a obecných procesů jejich diverzifikace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EH - Ecology - communities
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The Czech and Slovac populations of snow algal species from the genus Chloromonas are characterised by high degree of geographic isolation, indicating limited dispersal ability. New localities of snow algae were discovered in the frame of the project.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 1, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
910 thou. CZK
Public financial support
910 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK