Genome-wide analysis of male gametophyte transcription factor network in Arabidopsis thaliana
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 2 (SAV02004-J)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Celogenomová analýza sítě transkripčních faktorů účastnících se regulace vývoje samčího gametofytu Arabidopsis thaliana
Annotation in Czech
Pohlavní rozmnožování semenných rostlin vyžaduje existenci samčího gametofytu, pylu. Naše znalosti regulačních mechanismů ovlivňujících zahájení a průběh gametofytického vývojového programu a zajišťujících jeho bezchybný průběh na úrovni buněčné diferenciace, jsou velice omezené. Rozdílné profily exprese genů aktivních během dozrávání a klíčení pylu ukazují na existenci specifických mechanismů regulace jednotlivých skupin pylových genů. Podstatou předkládaného projektu je 1) vytvořit a zveřejnit databázi gametofytických transkripčních faktorů včetně jejich expresních dat; 2) z popsaných faktorů provést po aplikaci níže popsaných selekčních kritérií funkční analýzu vybraných pylově specifických regulátorů a 3) pro dva transkripční faktory s prokázanou biologickou funkcí (jeden časný, aktivní v mikrosporách, a jeden pozdní, aktivní v dozrávajícím pylu a pravděpodobně v pylových láčkách) pomocí jejich ektopické overexprese a následné čipové analýzy popsat skupiny jimi regulovaných genů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
We identified transcription factors (TF) expressed in arabidopsis male gametophyte and generated transcriptomic database arabidopsisGFP. We characterised insertion mutants in TF-encoding genes and used two genes for planned microarray experiment.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Apr 3, 2009
Finance
Total approved costs
8,912 thou. CZK
Public financial support
2,783 thou. CZK
Other public sources
6,129 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK