Virulence factors of Burkholderia cepacia complex bacteria involved at various stages of infection in patients with cystic fibrosis
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
COST CZ
Call for proposals
COST CZ 1 (SMSM2011LD1)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-3/2013-311
Alternative language
Project name in Czech
Faktory virulence bakterií komplexu Burkholderia cepacia, které se účastní různých fází infekce u pacientů s cystickou fibrózou
Annotation in Czech
Projekt si klade za cíl popsat změny v genové expresi, které se odehrávají na straně patogena (komplexu Burkholderia cepacia, Bcc) v průběhu postupného zhoršování klinického stavu pacientů s cystickou fibrózou. Pomocí technologie DNA čipů bude vyšetřen asrovnán transkriptom Bcc (3 druhů) generovaný za podmínek růstu ve sputu a v séru, které byly odebrány od pacientů ve fázi klinicky stabilní infekce, exacerbace a cepacia syndromu. Každou podmínku budou reprezentovat alespoň tři biologické replikáty. Vybrané geny kódující pravděpodobné faktory patogenity (odhadem 6-8) budou testovány pro možnost praktického využití jako markerů monitorování stavu infekce na dalších vzorcích klinického materiálu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
FC - Pneumology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>30203 - Respiratory systems
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Isolates from bloodstram exhibited down-regulated gene expression for flagellar genes. This flagella-mediated loss of motility was maintained in sputum isolaes prior to the development of septicaemia and can be utilized as marker of poor prognosis for chronic infection in cystic fibrosis. Transcriptome analysis was applied also to B. contaminans with isolates from blood and sputum.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-MSM-LD-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2015
Finance
Total approved costs
3,038 thou. CZK
Public financial support
2,444 thou. CZK
Other public sources
594 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK