Characterization and application of fungal non-heme oxidases
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
COST CZ
Call for proposals
COST CZ 2 (SMSM2012LD2)
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-7027/2012-36
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace a aplikace fungálních nehemových oxidas
Annotation in Czech
Cílem projektu je produkce a charakterizace nových nehemových oxidas fungálního původu pro biotechnologické aplikace. Zaměříme se zejména na tyrosinasy basidiomycet. Bude zjištěn výskyt tyrosinas u sbírkových kultur těchto hub a proveden průzkum databasígenů a proteinů s cílem najít hypotetické enzymy homologní se známými tyrosinasami, a konstruovány homologní modely nových enzymů. Vybrané enzymy budou exprimovány v heterologních hostitelských kmenech, purifikovány a charakterizovány, a bude proveden pokus krystalizovat vybraný enzym pro rentgenostrukturní analýzu. Na základě poznatků o substrátové specifitě a stabilitě budou zvoleny enzymy vhodné pro biodegradaci a detekci fenolických polutantů (hlavně chlorovaných a bromovaných fenolů, bisfenolu A,tetrabromobisfenolu A) a pro přípravu jejich metabolitů. Pro tento účel budou dále využity syntetické katalyzátory dostupné v konsorciu akce a budou porovnány produkty a účinnost těchto katalyzátorů a námi připravených enzymů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EI - Biotechnology and bionics
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
CC - Organic chemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project contributed to the development of methodical approaches to be used in metatranscriptomics and also delivered metagenomic and metatranscriptomic characteristics of soil biotopes with pan-european importance. Most emphasis was devoted to the analysis of sequencing data, obtained from selected ecosystems in the Czech Republic, Europe and worldwide.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MSM-LD-U/02:1
Data delivery date
Oct 11, 2017
Finance
Total approved costs
1,741 thou. CZK
Public financial support
1,741 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK