Development of marker panel for genotyping and molecular characterization of Blumeria graminis f.sp. hordei isolates
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
COST CZ
Call for proposals
COST CZ 4 (SMSM2014LD4)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-8634/2014-1
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj panelu markerů pro genotypování a molekulární charakterizaci izolátů B. graminis f. sp. hordei
Annotation in Czech
Detailní molekulární charakterizace genotypů izolátů B. graminis hordei s identifikovanými virulencemi (v návaznosti na spolu podávaný fenotypovací projekt) umožní studovat strukturu a dynamiku změn v populacích fytopatogenní houby B. graminis hordei na úrovni genomu. Tyto poznatky budou v rámci pracovních skupin COST Action FA1208 uplatněny k hledání možnosti včasné diagnostiky a vytváření vhodné odolnosti hostitelů (v našem případě zvláště odrůd ječmene ozimého) s širokým spektrem účinnosti k patogenu B. graminis hordei.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
CEP - another secondary branch
GE - Plant cultivation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project „Development of marker panel for genotyping and molecular characterization of Blumeria graminis f.sp. hordei isolates” facilitated identification of almost a mil. DNA motives useful as molecular markers including over 400 thousand SNPs using NGS approach. Such markers are prerequisite for study, gene identification and molecular characterization of barley Powdery mildew disease within Czech Republic. Such markers were unavailable so far.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2014
Realization period - end
Apr 1, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 28, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-LD-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2018
Finance
Total approved costs
2,121 thou. CZK
Public financial support
2,121 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK