Role of microRNAs in the regulation of cell wall biosynthesis - implications for the fertility of crop plants
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
COST CZ
Call for proposals
COST CZ 4 (SMSM2014LD4)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-8634/2014-1
Alternative language
Project name in Czech
Úloha miRNA v regulaci biosyntézy buněčné stěny - důsledky pro fertilitu hospodářských plodin
Annotation in Czech
Hlavním cílem navrhovaného výzkumu je prokázat mechanismus represe a aktivace translace syntézy proteinů buněčné stěny během růstu pylové láčky a zejména prokázat zapojení miRNA jako regulátorů translace skladovaných mRNA v tomto procesu. Na základě našich předběžných výsledků můžeme hlavní cíl rozdělit na tři dílčí cíle: 1) důkladné bioinformatické zpracování populací miRNA získaných hlubokým sekvenováním malých RNA isolovaných z pylu, 2) identifikace a analýza možných cílů identifikovaných miRNA homologních k transkriptům kódujícím proteiny buněčné stěny a 3) přímé potvrzení aktivity vybraných miRNA při regulaci exprese vybraných cílových transkriptů, demonstrace možnosti manipulace exprese složek buněčné stěny mechanismem RNAi.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
ED - Physiology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Within the time scale of the project, we have developed an effective technique, semi in vivo pollen tube secretome assay (SIV-PS) to identify proteins secreted by the pollen tubes to the extracellular matrix, including enzymes required for cell wall modifications. Our SIV-PS method also revealed differential mechanical properties of pollen tube cell wall in comparison to pollen tubes grown in vitro. Collectively, we showed that free germinated pollen tubes in vitro, possess different cell wall mechanical properties to those pollen tubes that need to penetrate the pistil tissues. Therefore, this assay offers a unique tool to elucidate how the mechanical properties of the pollen tube is established and could serve as a tool to customize pollen tube cell wall structure.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 1, 2014
Realization period - end
May 23, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 12, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-MSM-LD-U/01:1
Data delivery date
Jun 23, 2017
Finance
Total approved costs
1,559 thou. CZK
Public financial support
1,559 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK