Study of genetic diversity of Pinus sylvestris populations including marginal ecotypes in Czech republic by DNA analyses
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
COST CZ
Call for proposals
COST CZ 4 (SMSM2014LD4)
Main participants
Výzkumný ústav lesního hospodářství a myslivosti, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-8634/2014-1
Alternative language
Project name in Czech
Studium genetické diverzity populací borovice lesní zahrnující i okrajové ekotypy v České republice pomocí DNA analýz
Annotation in Czech
Cílem navrhovaného projektu je získání a upřesnění poznatků o genetické diverzitě marginálních populací borovice lesní v České republice pomocí DNA analýz. V rámci projektu budou zjišťovány vhodné markery, optimalizovány a standardizovány metody DNA analýz a vytvářena databáze. Získané informace o genetické struktuře vybraných marginálních populací lesních dřevin budou využity v rámci mezinárodní spolupráce akce COST FP1202 pro doplnění informací o území ČR.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GK - Forestry
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EH - Ecology - communities
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics<br>40102 - Forestry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Fourteen microsatellite markers were verified as highly polymorphic and suitable for genotyping marginal Scots pine populations. We optimized PCR conditions for selected markers and fragmentation analyses were performed using the genetic analyser. The parameters of genetic diversity were calculated for studied populations. The genotypic data imply genetic differences among the marginal populations located on serpentine and other studied populations.
Solution timeline
Realization period - beginning
Apr 4, 2014
Realization period - end
Nov 7, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 12, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-MSM-LD-U/01:1
Data delivery date
Jun 23, 2017
Finance
Total approved costs
1,934 thou. CZK
Public financial support
1,934 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK