Collaboration with Bioversity International on global analysis and conservation of genetic diversity of bananas
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INGO II
Call for proposals
INGO II 2 (SMSM2012LG2)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-7030/2012-36
Alternative language
Project name in Czech
Spolupráce s Bioversity International na globální analýze a uchovávání genetické diverzity banánovníku
Annotation in Czech
Cílem projektu je prohloubit a rozšířit spolupráci s Bioversity International a charakterizovat genetickou diversitu zástupců čeledi Musaceae uchovávaných ve světové genové bance (asi 500 položek) a to včetně nových položek, které budou v době řešení projektu do banky zařazovány (asi 150 položek). Analýzy budou prováděny s využitím genotypovací platformy v laboratoři řešitele. Díky komplexnímu přístupu, který kromě genotypování pomocí 19 mikrosatelitových markerů využívá informace o ploidii budou identifikovány položky obsahující více genotypů, mixoploidní položky, nesprávně popsané položky a duplikované položky. U položek, u kterých genotypování pomocí mikrosatelitových markerů neposkytne jednoznačné výsledky, budou analyzovány nukleotidové sekvence krátkého mezerníku 45S rRNA genů (ITS sekvence). Získaná data budou použita pro fylogenetickou analýzu s cílem objasnit původ pěstovaných forem banánovníku.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Genotype of 150 accessions of banana obtained from international gene bank was characterized. Their ploidy was estimated using flow cytometry. The results of DNA cytometry were confirmed in 25 accessions by chromosome counting in root tip meristem cells.All accessions were genotyped using 19 microsatellite markers. Analysis of ITS spacer was done in 62 selected accessions.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 25, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-MSM-LG-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2015
Finance
Total approved costs
3,943 thou. CZK
Public financial support
2,923 thou. CZK
Other public sources
1,020 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK