Modeling of Electronically Excited States in Nucleic Acids: Combined Theoretical and Experimental Study
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 1 (SMSM2011LH1)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
6970/2011-320
Alternative language
Project name in Czech
Modelování elektronicky excitovaných stavů v nukleových kyselinách: kombinovaná experimentální a teoretická studie.
Annotation in Czech
Cílem projektu je kombinované teoretické a experimentální studium, které přispěje k lepšímu porozumění interakcí bází nukleových kyselin ve svých excitovaných stavech a vlivu těchto interakcí na dynamické chování bází. Dílčími cíli je porozumění (i) vlivu charakteru excitovaného stavu na jeho dynamické chování a povahu interakce, (ii) vlivu sekvence bází a jejich vzájemné konformace na povahu interakce excitovaných bází nukleových kyselin, možnost tvorby excimerů nebo lokalizaci excitovaného stavu, (iii) povahy dynamiky relaxace interagujících bází do základního stavu. Praktickým dopadem této studie je lepší pochopení fotochemie excitovaných stavů v systémech s více chromofóry s potenciálním využitím v biologických disciplínách.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CF - Physical chemistry and theoretical chemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10403 - Physical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Ab initio studies were performed to reveal the changes of excited states of chromophores due to the interaction with environment, stacking interactions and hydrogen bonds. The following systems were studied: N-methyl-formamide dimers, xanthine dimer, guanine-cytosine in DNA dodecamer. In the collaboration with the partner group the monophospate nucleotides and their clusters were also studied.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 6, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2014
Finance
Total approved costs
638 thou. CZK
Public financial support
638 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK