The role of alternative splicing in evolution of vertebrate body plan
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-6805/2013-311
Alternative language
Project name in Czech
Role alternativního sestřihu mRNA v evoluci stavby těla obratlovců
Annotation in Czech
Předložený projekt si klade za cíl studovat význam alternativního sestřihu mRNA jako možného faktoru při evoluci komplexní stavby těla obratlovců. Kmen strunatců zahrnuje obratlovce a jim nejbližší příbuzné druhy bezobratlích, kopinatce a pláštěnce. Projekt má tyto cíle:(1)Zjistit rozsah evoluční konzervace alternativního sestřihu mRNA genů Pax v rámci různých druhů kopinatce (Branchiostoma, Asymmetron). (2)Porovnat alternativní sestřih genů Pax u kopinatce se sestřihem u pláštěnců (Ciona) a obratlovců(Danio, Oryzias).(3)Provést molekulární charakterizaci vybraných alternativních transkriptů.(4) Porovnat expresi alternativních transkriptů u jednotlivých modelových strunatců (Branchiostoma, Ciona, Danio, Oryzias).(5) Určit biologickou funkci alternativních transkriptů in vivo. Tyto dílčí cíle a harmonogram jejich plnění jsou navrženy tak, aby byla vysoká pravděpodobnost jejich úspěšného splnění. Proto jsou některé z nich rozvržené do delšího úseku a je na ně alokováno větší množství lidských zdrojů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
"An international collaboration project between laboratories of Dr. Zbynek Kozmik (IMG ASCR v.v.i.)and Dr. Linda Holland (Scripps Institution of Oceanography) focused on evolutionary conservation of alternative splicing in Pax gene family. Project support lead at the time of support ending in 2015 to three publications containing dedication to project in international reviewed journals."
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Oct 9, 2017
Finance
Total approved costs
2,885 thou. CZK
Public financial support
2,885 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK