All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”
LH12104

Posttranscriptional modifications of tRNAs in Trypanosoma brucei

Public support

  • Provider

    Ministry of Education, Youth and Sports

  • Programme

    KONTAKT II

  • Call for proposals

    KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)

  • Main participants

    Biologické centrum AV ČR, v. v. i.

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    MSMT-6805/2013-311

Alternative language

  • Project name in Czech

    Posttranskripční úpravy tRNA u trypanosomy spavičné

  • Annotation in Czech

    Tento projekt si klade za cíl studovat nejrůznější aspekty tRNA modifikací u parazitického prvoka Trypanosoma brucei. Konkrétně nás zajímá, jak různé modifikace ovlivňují import tRNA do mitochondrie. Domníváme se, že některé modifikace by mohli zabraňovat importu a tím regulovat poměr tRNA v cytosolu a mitochondrii. Dále se chceme zabývat rolí modifikací tRNA při translaci mitochondriálně kódovaných proteinů. Jejich výskyt v mitochondrii dáváme do souvislosti s rozsáhlým editováním mitochondriálních transkriptů, které tímto mechanismem získají velký počet uridinů. Modifikované tRNA zajišťují správné čtení genetické informace a zabraňují sklouzávání ribozomu. A v neposlední řadě se zaměříme na studium provázanosti dráhy pro tvorbu Fe-S center a tRNA modifikačních enzymů. Řada těchto enzymů totiž potřebuje pro svoji aktivitu Fe-S centra, která vznikají de novo v mitochondrii. Nicméně připouštíme i možnost, že se proteiny Fe-S dráhy účastní přímo tvorby tRNA modifikací.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

    FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology

  • CEP - another secondary branch

    EE - Microbiology, virology

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    We studied genes involved in tRNA modification (methylation, thiolation) and iron-sulfur cluster assembly in Trypanosoma brucei. We showed that ABCB transporter Atm1, the key player in cluster formation, is affecting also tRNA modification called thiolation, in contrast to another studied ABCB transporter Mdl, which is important for heme homeostasis. We further studied methyltransferases, TbMTase37 which is important for ribosome stability in T. brucei. TbMTase37 localizes to the nucleolus and depletion of the protein results in reduced levels of polysome associated ribosomes.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Mar 1, 2012

  • Realization period - end

    Dec 31, 2015

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Feb 27, 2015

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP16-MSM-LH-U/01:1

  • Data delivery date

    Oct 9, 2017

Finance

  • Total approved costs

    3,988 thou. CZK

  • Public financial support

    3,648 thou. CZK

  • Other public sources

    340 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK