Posttranscriptional modifications of tRNAs in Trypanosoma brucei
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 2 (SMSM2012LH2)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-6805/2013-311
Alternative language
Project name in Czech
Posttranskripční úpravy tRNA u trypanosomy spavičné
Annotation in Czech
Tento projekt si klade za cíl studovat nejrůznější aspekty tRNA modifikací u parazitického prvoka Trypanosoma brucei. Konkrétně nás zajímá, jak různé modifikace ovlivňují import tRNA do mitochondrie. Domníváme se, že některé modifikace by mohli zabraňovat importu a tím regulovat poměr tRNA v cytosolu a mitochondrii. Dále se chceme zabývat rolí modifikací tRNA při translaci mitochondriálně kódovaných proteinů. Jejich výskyt v mitochondrii dáváme do souvislosti s rozsáhlým editováním mitochondriálních transkriptů, které tímto mechanismem získají velký počet uridinů. Modifikované tRNA zajišťují správné čtení genetické informace a zabraňují sklouzávání ribozomu. A v neposlední řadě se zaměříme na studium provázanosti dráhy pro tvorbu Fe-S center a tRNA modifikačních enzymů. Řada těchto enzymů totiž potřebuje pro svoji aktivitu Fe-S centra, která vznikají de novo v mitochondrii. Nicméně připouštíme i možnost, že se proteiny Fe-S dráhy účastní přímo tvorby tRNA modifikací.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
FN - Epidemiology, infection diseases and clinical immunology
CEP - another secondary branch
EE - Microbiology, virology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
We studied genes involved in tRNA modification (methylation, thiolation) and iron-sulfur cluster assembly in Trypanosoma brucei. We showed that ABCB transporter Atm1, the key player in cluster formation, is affecting also tRNA modification called thiolation, in contrast to another studied ABCB transporter Mdl, which is important for heme homeostasis. We further studied methyltransferases, TbMTase37 which is important for ribosome stability in T. brucei. TbMTase37 localizes to the nucleolus and depletion of the protein results in reduced levels of polysome associated ribosomes.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 27, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Oct 9, 2017
Finance
Total approved costs
3,988 thou. CZK
Public financial support
3,648 thou. CZK
Other public sources
340 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK