Functional interaction between host gene regulation and the microbiome in the primate gut
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 5 (SMSM2015LH5)
Main participants
Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-32267/2015-1
Alternative language
Project name in Czech
Funkční interakce mezi genovou regulací hostitele a mikrobiotou v trávicím traktu primátů
Annotation in Czech
Navrhovaný projekt si klade za cíl popsat přímé vztahy mezi markery genové exprese na gastrointestinální úrovni a složením střevní mikrobioty a potažmo úlohou střevní mikrobioty u dvou hostitelských druhů z čeledi Hominidae; goril nížinných a lidí žijícím tradičním lovecko-sběračským způsobem. Tento komparativní přístup ukáže, jak předpokládaná změna v dietě v průběhu evoluce může aktivovat různé genetické a mikrobiomové adaptace týkající se samotného metabolismu a imunity ve střevě. V rámci projektu dojde k upevnění kontaktů mezi laboratoří navrhovatelů a zahraničním pracovištěm v USA a s tím spojenou implementaci nových znalostí v oblasti metabolomiky a výzkumu mikrobiomu hominidů a neinvazivních přístupech sekvenace RNA na pracoviště českého navrhovatele. Tyto znalosti budou využity během řešení projektu, ale i v dalších plánovaných projektech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EE - Microbiology, virology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40301 - Veterinary science
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Our project shows that gene regulation profiles, distinguishing the colonic tissue of apes and humans, correlate strongly with the abundance of particular metabolites and bacterial taxa. Compared to apes, humans have evolved differential expression of immune-associated genes in response to lipidic metabolites and higher abundance of saccharolytic bacteria. The findings underscore the pivotal role that diet could have had in microbe-primate diversification.
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2015
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 2, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Jun 7, 2018
Finance
Total approved costs
1,997 thou. CZK
Public financial support
1,997 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK