Phage replication in bacterial biofilm
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
ERC CZ
Call for proposals
SMSM2019LL001
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-35696/2019-1
Alternative language
Project name in Czech
Replikace fágů v bakteriálním biofilmu
Annotation in Czech
"Když bakterie zlatého stafylokoka (Staphylococcus aureus) vytvoří biofilm v lidském těle, začnou být chráněny před imunitním systémem a stanou se odolnějšími vůči antibiotikům. Současné možnosti léčby biofilmů jsou omezeny na dlouhodobé aplikace kombinací několika antibiotik ve vysokých dávkách, nebo chirurgické odstranění infikovaných tkání. V tomto projektu plánujeme studovat jak fágy z čeledi Myoviridae, přirození zabijáci bakterií, infikují biofilm. Předpokládáme, že nám tyto studie umožní identifikovat nové strategie pro vývoj antimikrobiálních sloučenin nebo fágové terapie. Pro analýzu vlivu fágové infekce na mnohobuněčnou strukturu biofilmu použijeme kombinaci metod ořezávání vzorku zaostřeným iontovým paprskem a kryo-elektronovou tomografii. Popíšeme roli bakteriálních proteinů v doručení fágového genomu do bakterií, určíme strukturu fágových replikačních „továren“ a identifikujeme úlohu chaperonů a hostitelských membrán v morfogenezi fágových partikulí. S pomocí fluorescenční mikroskopie budeme charakterizovat vztah mezi fází vývoje biofilmu a jeho citlivostí k fágové infekci. Změříme účinnost a délku trvání fágového replikačního cyklu v dormantních a perzistentních buňkách a určíme, zda S. aureus v biofilmu používá komunitní obranu proti fágové infekci. Hlavní inovace v našem přístupu jsou: stanovení struktur fágových makromolekulárních komplexů s vysokým rozlišením pomocí kryo-elektronové mikroskopie a tomografie buněčných řezů, použití CRISPR / Cas systému pro modifikaci fágových genomů a pozorování šíření fágové infekce biofilmem pomocí časově rozlišené fluorescenční mikroskopie. Biologický význam tohoto projektu spočívá v jeho zaměření na pochopení interakcí fágů a patogenních bakterií v klinicky relevantních podmínkách. Naše analýzy šíření fágů in vivo, mechanismu doručení a replikace fágových genomů, a sestavování fágových částic povedou k určení funkcí makromolekulárních komplexů, které jsou nezbytné pro propagaci fágů v biofilmu. "
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project Phage infection of bacterial biofilm, supported by the ERC-CZ scheme, focused on the characterization of the structure and infection process of phages infecting pathogenic and antibiotic-resistant bacteria. The most important result is the description of phage SU10 published in Nature Communications. This project’s biological significance lies in its focus on the as-yet uncharacterized interactions of phages and bacteria under biologically and clinically relevant conditions.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 4, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LL-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
35,299 thou. CZK
Public financial support
35,299 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK