RNA Silencing and Transposable Elements in a Slug Laboratory Model
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
ERC CZ
Call for proposals
SMSM2024LL001
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-1992/2024-1
Alternative language
Project name in Czech
RNA silencing a mobilní elementy v laboratorním modelu slimáka
Annotation in Czech
RNA silencing je skupina důležitých evolučně příbuzných mechanismů, které využívají malé RNA pro navádění sekvenčně specifického umlčování genů, ochranu genomu před transpozibilními elementy (TE) a protivirovou imunitu aktivovanou dvouřetězcovou RNA (dsRNA). Pochopení divergence těchto molekulárních mechanismů "ve světle evoluce" je silně vychýlené vůči několika modelovým orgatev evolučního stromu živočichů pro získání širších poznatků o konzervovaných a odvozených vlastnostech molekulárních mechanismů. Moje analýza slimáka Arion vulgaris naznačuje jedinečné nastavení RNA silencingu a reakce na parazitické nukleové kyseliny, což možná odráží mimořádné rozšíření long interspersed nuclear element (LINE) TE v jeho genomu a předpokládaný nižší virový tlakem v suchozemském prostředí. RT-SLAM tak určí reakci slimáků na dsRNA a způsob, jakým jejich evoluce integrovala (nebo zanedbala) RNA silencing. Důležité také je, že suchozemští slimáci představují skvělý model pro pochopení vzájemného působení mezi RNA silencingem a expanzí LINE. Odhalíme, jak RNA silencing slimáků poskytuje adaptivní odpověď na rozpoznání a umlčení aktivních LINE elementů a jak se tato odpověď zahrnuje nejen zárodečnou linii ale i soma. To se týká také savců, u nichž RNA silencing rovněž brzdí expanzi mutagenních LINE elementů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2024
Realization period - end
Sep 30, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Oct 7, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-MSM-LL-R
Data delivery date
Feb 20, 2025
Finance
Total approved costs
23,886 thou. CZK
Public financial support
23,886 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK