Center of Integrated Genomics
Project goals
The proposed Center of Genomics is created to enable collaboration of top laboratories in various aspects of genomics with the aim to fully develop the field of integrated genomics not existing in the Czech Republic. The Center would serve asa methodicalbase and a center for education of graduate students. Individual collaborating research groups have knowledge and technical equipment for developing specialized parts of genomics.Large-scale DNA sequencing (of eg. bacterial genomes) is well establishedand basic tools of bioinformatics are available. Development of chip technology, including the SAGE method, is of particular importance. Mammalian functional genomics is realizedat the level of positional cloning of genes for sterility, imprinting, eye development, hypertension and mitochondrial diseases. The Center will elaborate complex genomics methodology and apply it to biomedical and biotechnology projects.
Keywords
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
—
Call for proposals
SMSM0031008
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Centrum integrované genomiky
Annotation in Czech
Navrhuje se vytvoření Centra genomiky, jež unožní spolupráci předních laboratoří tak, aby se plně rozvinul v ČR dosud neexistující obor integrované genomiky. Centrum by bylo metodickou základnou genomiky,školícím pracovištěm zejména doktorandů a garantemrozvoje oboru v ČR. Jednotlivé spolupracující řešitelské skupiny mají zkušenosti a metodické i přístrojové zázemí v určitých výsecích genomiky. Je zajištena sekvenace velkých úseků DNA(např. bakteriálních genomů), k dispozici jsou základní nástroje bioinformatiky. Mimořádně důlezité je rozvíjení čipové technologie včetne metody SAGE. Savčí funkční genomika je rozvíjena na úrovni pozičního klonování genu sterility,imprintingu, vývoje oka, hypertenze a mitochondriálních chorob. Centrum bude rozvíjet komplexní metodologii genomiky a bude ji aplikovat v biomedicínských a biotechnologických projektech jak uvedeno v návrhu.
Scientific branches
R&D category
NV - Nonindustrial research (Applied research excluded Industrial research)
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Major achievements are: global characterization of mouse male sperm cells gene expression and identification of the gene responsible for human familiar juvenile nephropathy.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2000
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/MSM/MSM5LN/U/N/4:2
Data delivery date
May 28, 2008
Finance
Total approved costs
132,608 thou. CZK
Public financial support
106,170 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
26,438 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
132 608 CZK thou.
Public support
106 170 CZK thou.
80%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2000 - 01. 01. 2004