Proteomic inventarization of integral membrane proteins in human pheochromocytoma and paraganglioma - paving the way towards novel diagnostic and therapeutic approaches.
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 1 (SMSM2016LTA01)
Main participants
Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-16988/2017-1
Alternative language
Project name in Czech
Proteomická inventarizace membránových proteinů lidských neuroendokrinních nádorů feochromocytomu a paragangliomu jako cesta k inovaci diagnostických a terapeutických přístupů
Annotation in Czech
Cílem projektu je dosažení úplného (v rámci možností nejlepších současných technik) popisu sady integrálních membránových proteinů exprimovaných jednotlivými typy neuroendokrinních nádorů feochromocytomu a paragangliomu u člověka. Tato studie: 1) poskytne informaci pro výběr vhodných proteinů jako potenciálních cílů pro budoucí protinádorovou terapii (druggable targets and epitopes) těchto nádorů včetně terapeutických protilátek. 2) bude zdrojem informace zpřesňující klasifikaci tohoto typu nádorů a měla by rovněž umožnit návrh potenciálních biomarkerů pro zpřesnění diagnózy. 3) poskytne nové poznatky o biologii neuroendokrinních nádorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
FD - Oncology and haematology
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
CE - Biochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
We developed a new four-pronged “Pitchfork” strategy for extensive analysis of membrane proteome. The combined strategy was applied to 14 phochromocytoma and paraganglioma tumor samples, resulting in identification of 1000-1200 membrane proteins in each patient sample. In total we identified roughly 2500 integral membrane proteins expressed in pheochromocytoma and paraganglioma.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 17, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 19, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-MSM-LT-U/01:2
Data delivery date
Jun 8, 2020
Finance
Total approved costs
2,455 thou. CZK
Public financial support
2,455 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK