Mysteries of nitrogen regulation in yeast populations: Functions of TORC1 and other nutrient sensing pathways
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 10 (SMSM2018LTA02)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-39022/2018-1
Alternative language
Project name in Czech
Spletitosti dusíkové regulace u populací kvasinek: Funkce TORC1 dráhy a dalších drah detekce živin
Annotation in Czech
Projekt mezinárodní spolupráce s Prof. T. G. Cooperem z University v Tennessee, TN, USA, je zaměřen na objasnění centrálních regulačních mechanismů zapojených do buněčné odpovědi na změny prostředí a ovlivňujících stárnutí buněk. Konkrétním cílem je objasnit mechanismy alternativních regulačních drah reagujících na podněty vyvolané změnami dusíkových metabolitů, určit, jak se vzájemně ovlivňují, a identifikovat chybějící regulační komponenty. Centrálním „hráčem“ v těchto regulacích u eukryot je konzervovaný protein-kinázový komplex TORC1, a jím regulované transkripční faktory GATA. V projektu využijeme kvasinkové populace kultivované za definovaných podmínek hladovění i unikátní model mnohobuněčných kolonií, tvořených specifickými diferencovanými buňkami, včetně těch, které, jak ukázaly české týmy, mají unikátní vlastnosti, pokud jde o regulaci TORC1, podobné vlastnostem buněk pevných nádorů. Projekt tak vychází z unikátních zjištění jak českých týmů, tak US partnera, který identifikoval alternativní dráhy, které ovlivňují funkce GATA faktorů za specifických podmínek. Společný výzkum a využití komplementárního know-how participujících týmů synergicky urychlí plánovaný výzkum a vytvoří znalostní základnu, která vzhledem k vysoké konzervovanosti studovaných drah nalezne uplatnění ve výzkumu TORC1 a dalších drah dusíkové regulace u savčích buněk, včetně buněk nádorových. Výsledkem projektu budou publikace v prestižních zahraničních vědeckých časopisech.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30101 - Human genetics
OECD FORD - secondary branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - another secondary branch
10607 - Virology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology<br>EE - Microbiology, virology
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Research on nitrogen metabolism regulation continued as planned; a collaboration was established with US partner. Among other things, we studied functions of Whi2p, the putative negative regulator of TORC1. In articles in PNAS and G3, we showed that Whi2p plays a key role in coordinated development of the multicellular population with active TORC1, in contrast to the situation in liquid cultures.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
11,301 thou. CZK
Public financial support
11,301 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK