Electron and proton transfer in ionized DNA fragments
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
SMSM2019LTA01
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-37785/2019-2
Alternative language
Project name in Czech
Přenos elektronu a protonu v ionizovaných fragmentech DNA
Annotation in Czech
Hlavní cíle projektu spadají do dvou úzce spjatých kategorií. První kategorií je organická syntéza vhodných oligonukleotidů jako modelových látek pro studium přenosu elektronu a protonu v kationradikálech DNA. Oligonukleotidy specificky značené stabilními izotopy v nukleových bázích budou použity k rozlišení izobarických degenerací při disociaci radikálů majících dvě nebo více formálně identických nukleobází, např. A....A, A...A...A, C....C, pro další kombinace. Druhou kategorií navrhovaného projektu je příprava nabitých radikálů DNA v plynné fázi a jejich lapení v iontové pasti hmotnostního spektrometru po dobu několika milisekund. Takto připravené radikálové ionty budou zkoumány pomocí vibrační a elektronické excitace a jejich rozpady a hmotnostně spektrometrická analýza produktů budou použity k objasnění přenosů elektronu a protonu vlivem excitace. Získaná data a jejich interpretace pomocí kvantově-chemických výpočtů přinesou důležité informace o kinetice a mechanismech procesů vedoucích k poškození DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10406 - Analytical chemistry
OECD FORD - secondary branch
10401 - Organic chemistry
OECD FORD - another secondary branch
10402 - Inorganic and nuclear chemistry
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CA - Inorganic chemistry<br>CB - Analytical chemistry, separation<br>CC - Organic chemistry<br>CH - Nuclear and quantum chemistry, photo chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
"Over the years 2020–2022, for the first time complete fragmentation maps were generated for cations, dications, and cation radicals of DNA codons (64×). The results of the project were presented in the form of six scientific peer-reviewed articles and ten oral/poster presentations at international conferences."
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 1, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
4,376 thou. CZK
Public financial support
3,581 thou. CZK
Other public sources
795 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK