Detection of tomato related xanthomonads using loop-mediated isothermal amplification
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 22 (SMSM2019LTC01)
Main participants
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Fakulta zemědělská a technologická
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-15739/2019-8
Alternative language
Project name in Czech
Detekce xantomonád způsobujících onemocnění rajčete pomocí metody loop-mediated isothermal amplification
Annotation in Czech
Hlavním cílem projektu je vypracování metody molekulární detekce bakterií rodu Xanthomonas způsobujících bakteriální skvrnitost rajčete. Metoda molekulární detekce bude založena na nově vyvinutém a optimalizovaném postupu využívající metodu loop-mediated isothermal amplification. Bude ověřena funkčnost a specifičnost molekulární detekce. Dalším cílem projektu bude ověřování a standardizace molekulárních nástrojů pro detekci fytopatogenních xantomonád vyvinutých ostatními členy COST akce EuroXanth.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
OECD FORD - secondary branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - another secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology<br>EE - Microbiology, virology<br>GC - Plant growing, crop rotation<br>GE - Plant cultivation<br>GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The main benefit of the LTC19014 project is the developing cooperation with a foregn partner. This has resulted in joint publications in the journals Microorganisms and Bioinformatics, describing a system for detection of Xanthomonas gardneri by LAMP and an algorithm for searching of unique DNA sequences. Also, a manuscript of a joint paper, which was not planned in the project, is in the final stages of preparation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jun 1, 2019
Realization period - end
Sep 15, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 15, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
1,146 thou. CZK
Public financial support
1,146 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK