Advanced correlated light and electron microscopy as a tool for studying novel nuclear structures and their impact on the gene transcription and global nuclear architecture
Project goals
Aims of the project: 1. Development of a method for correlative super-resolution light and transmission electron microscopy (CLEM) for characterization of lipid islets (NLI) in the cell nucleus. 2. Study of ultrastructure, composition and close neighbourhood of NLI by the developed CLEM technique. 3. Development of a complex CLEM method with combination of 2D and 3D immunolabeling for study of spatial interactions of functional molecules in the cell nucleus. 4. Characterization of NLI in vivo in germ cells of C. elegans, including worms with laminopathic mutations. 5. Extension of the CLEM method with additional techniques (EDS, cryo-TEM).
Keywords
Correlative light and electron microscopy (CLEM)cell nucleusphosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PIP2)C. elegans
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
INTER-EXCELLENCE
Call for proposals
INTER-EXCELLENCE 22 (SMSM2019LTC01)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-15739/2019-28
Alternative language
Project name in Czech
Pokročilá korelační světelná a elektronová mikroskopie jako nástroj pro studium nových jaderných struktur a jejich vlivu na genovou transkripci a globální jadernou architekturu
Annotation in Czech
Cílem projektu je přispět k objasnění struktury, složení a funkčních interakcí lipidových struktur v buněčném jádře – NLIs. Podstatnou částí obsahu projektu je testování, optimalizace a vývoj nových postupů korelační světelné a elektronové mikroskopie (CLEM), které umožní získání dat z různých typů mikroskopie ze stejné oblasti vzorku. Metodické a vědecké cíle projektu budou naplňovány s využitím experimentálních modelů savčích buněk a modelového organismu C. elegans, včetně háďátek s bodovými mutacemi laminu napodobujícími laminopatické mutace u lidí. Cíle projektu zahrnují: 1. Vývoj postupu korelační super-rezoluční světelné a transmisní elektronové mikroskopie (CLEM) pro charakterizaci lipidových ostrůvků v buněčném jádře. 2. Studium ultrastruktury, složení a nejbližšího okolí NLI pomocí vyvinuté metody CLEM. 3. Vývoj komplexní metody CLEM s kombinaci 2D a 3D imunoznačení pro studium prostorových interakcí funkčních molekul v objemu buněčného jádra. 4. Charakterizace NLI in vivo v zárodečných buňkách haďátek, včetně haďátek s laminopatickými mutacemi, metodou CLEM. 5. Rozšíření metody CLEM o další prístupy (EDS, kryo-TEM).
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
In this project, we have optimized and developed approaches enabling the study of lipid structures at high resolution and the correlation of different types of data from the same sample, including methods involving advanced cryo-methods, volumetric information and elemental analysis. New insights into the structure, composition and functional interactions of lipid structures in the cell nucleus were obtained
Solution timeline
Realization period - beginning
May 16, 2019
Realization period - end
Oct 11, 2022
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 25, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-MSM-LT-U
Data delivery date
Jun 30, 2023
Finance
Total approved costs
8,308 thou. CZK
Public financial support
8,308 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
8 308 CZK thou.
Public support
8 308 CZK thou.
100%
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
OECD FORD
Cell biology
Solution period
16. 05. 2019 - 11. 10. 2022